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水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展戰(zhàn)略研究(中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所研究員 陳松林)

 飛揚(yáng)AB 2016-08-04


陳松林,1960年10月出生,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所,研究員,研究方向?yàn)樗a(chǎn)生物技術(shù)和遺傳育種。農(nóng)業(yè)部海洋漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室常務(wù)副主任,中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院水產(chǎn)生物技術(shù)領(lǐng)域首席科學(xué)家, 中國(guó)水產(chǎn)學(xué)會(huì)水產(chǎn)生物技術(shù)專業(yè)委員會(huì)主任,山東省泰山學(xué)者特聘專家。

 

主要從事魚類基因資源發(fā)掘和分子育種、魚類細(xì)胞工程和性別控制、魚類胚胎干細(xì)胞培養(yǎng)和基因打靶、魚類低溫生物學(xué)及配子冷凍保存。

(信息來(lái)源:百度百科,未經(jīng)專家本人審核)




水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展戰(zhàn)略研究


陳松林,邵長(zhǎng)偉, 徐鵬

  

【摘要】

本文從水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因組測(cè)序、遺傳連鎖圖譜繪制、重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)分子標(biāo)記 / 基因篩選、基因組編輯、基因組選擇以及細(xì)胞培養(yǎng)與種質(zhì)冷凍保存等方面綜合介紹了水產(chǎn)生物技術(shù)的發(fā)展現(xiàn)狀,并深入分析了水產(chǎn)生物技術(shù)研究中存在的主要問(wèn)題,諸如基因功能分析平臺(tái)不完善,抗病與性控育種技術(shù)研究滯后,基因組編輯與全基因組選擇技術(shù)剛剛起步等。

 

同時(shí),圍繞上述主要問(wèn)題,提出了水產(chǎn)生物技術(shù)亟待突破的關(guān)鍵技術(shù),并建議“十三五”期間設(shè)立重點(diǎn)研究計(jì)劃專項(xiàng),深入開展水產(chǎn)動(dòng)物基因組資源開發(fā)與利用、重要經(jīng)濟(jì)性狀遺傳解析以及水產(chǎn)生物信息大數(shù)據(jù)平臺(tái)構(gòu)建等。



【提綱】

一、前言

二、 水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀

(一)水產(chǎn)生物全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制

(二)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物重要性狀相關(guān)功能基因發(fā)掘

(三)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物高密度遺傳連鎖圖譜繪制

(四)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物重要性狀相關(guān)分子標(biāo)記篩選與應(yīng)用

(五)全基因組選擇技術(shù)

(六)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因組編輯技術(shù)

(七)水產(chǎn)動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)

(八)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物種質(zhì)冷凍保存

三、水產(chǎn)生物技術(shù)研究中存在的主要問(wèn)題

(一)基因組資源開發(fā)進(jìn)展迅速,但水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物基因功能分析平臺(tái)尚未建立,滿足不了基因功能研究的需要

(二)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物抗病基礎(chǔ)研究及抗病分子育種研究投入低、進(jìn)展慢,滿足不了產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求

(三)性別特異分子標(biāo)記和分子輔助性控技術(shù)研究滿足不了魚類養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的需求

(四)基因組選擇剛剛起步,離良種選育應(yīng)用尚有距離

四、水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展戰(zhàn)略與關(guān)鍵技術(shù)

(一)發(fā)展戰(zhàn)略

(二)關(guān)鍵技術(shù)

五、水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展建議

(一)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物全基因組結(jié)構(gòu)解析及基因資源的深度挖掘

(二)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳解析及分子設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)研究

(三)重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物經(jīng)濟(jì)性狀形成的表觀遺傳與環(huán)境調(diào)控機(jī)制

(四)重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因信息大數(shù)據(jù)平臺(tái)構(gòu)建及應(yīng)用



 

一、前言

我國(guó)是世界第一大農(nóng)業(yè)生產(chǎn)與消費(fèi)國(guó),也是世界水產(chǎn)品生產(chǎn)大國(guó),產(chǎn)量連續(xù) 20 多年居世界首位?!皣?guó)以農(nóng)為本、農(nóng)以種為先”,種業(yè)作為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展的第一產(chǎn)業(yè)要素,是確保主要農(nóng)產(chǎn)品有效供給的重要物質(zhì)基礎(chǔ),種業(yè)科技的不斷創(chuàng)新已成為提升養(yǎng)殖業(yè)核心競(jìng)爭(zhēng)力的源泉。近年來(lái),伴隨著國(guó)家一系列關(guān)于“現(xiàn)代種業(yè)”“藍(lán)色經(jīng)濟(jì)”等戰(zhàn)略性指導(dǎo)方針、規(guī)劃的提出,我國(guó)水產(chǎn)種業(yè)發(fā)展迎來(lái)了前所未有的重大機(jī)遇。

 

水產(chǎn)生物技術(shù)作為水產(chǎn)種業(yè)發(fā)展的核心技術(shù),涉及到養(yǎng)殖學(xué)、遺傳學(xué)和育種學(xué)等多個(gè)學(xué)科,從群體、個(gè)體、細(xì)胞到基因等多種水平,從經(jīng)典技術(shù)到組學(xué)技術(shù)等多種技術(shù),從魚類、蝦蟹類、貝類到藻類等各類生物,可以說(shuō)是一個(gè)龐大的系統(tǒng)工程。特別是隨著基因組技術(shù)的發(fā)展,以水產(chǎn)基因組技術(shù)為核心的水產(chǎn)生物技術(shù)在水產(chǎn)良種培育、苗種繁育、種質(zhì)保存及病害防控等方面展現(xiàn)出巨大的應(yīng)用潛力和廣闊的應(yīng)用前景。

 

現(xiàn)代水產(chǎn)生物技術(shù)的研究?jī)?nèi)容主要包括水產(chǎn)生物全基因組解析和基因資源發(fā)掘技術(shù),重要經(jīng)濟(jì)性狀基因鑒定及功能分析技術(shù),基因組編輯、基因組選擇和分子設(shè)計(jì)技術(shù),水產(chǎn)基因工程產(chǎn)品的研制與利用技術(shù),種質(zhì)分子鑒定、評(píng)估與保存技術(shù)等。

 

近年來(lái),國(guó)內(nèi)外在水產(chǎn)生物全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜繪制上取得很大進(jìn)展,獲得了海量的基因資源信息,但在重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因鑒定和應(yīng)用、基因組編輯和基因組選擇、水產(chǎn)動(dòng)物胚胎批量化保存以及無(wú)脊椎動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)等技術(shù)上還存在一些問(wèn)題,滿足不了水產(chǎn)種業(yè)和養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的需要。我國(guó)“十三五”及今后相當(dāng)長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展對(duì)水產(chǎn)生物技術(shù)具有重大需求,大力發(fā)展以水產(chǎn)基因組技術(shù)為核心的水產(chǎn)生物技術(shù)研發(fā)是我國(guó)“十三五”期間的重大研究課題。


 

二、 水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展現(xiàn)狀(略,詳見原文鏈接)

 

三、水產(chǎn)生物技術(shù)研究中存在的主要問(wèn)題

 

(一)基因組資源開發(fā)進(jìn)展迅速,但水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物基因功能分析平臺(tái)尚未建立,滿足不了基因功能研究的需要

 

近年來(lái)我國(guó)學(xué)者相繼完成牡蠣、半滑舌鰨、鯉魚、草魚和大黃魚等的全基因組測(cè)序,成果陸續(xù)在《Nature》《Nature Genetics》等頂級(jí)期刊上發(fā)表。然而,在后基因組時(shí)代,重點(diǎn)將是基因功能驗(yàn)證和重要性狀的遺傳解析。但絕大多數(shù)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物,我國(guó)尚未建立轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶和 CRISPR/Cas9 等基因組編輯技術(shù)和平臺(tái),嚴(yán)重影響了重要性狀關(guān)鍵基因的發(fā)掘及其在遺傳育種和水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中的應(yīng)用。

 

(二)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物抗病基礎(chǔ)研究及抗病分子育種研究投入低、進(jìn)展慢,滿足不了產(chǎn)業(yè)發(fā)展的需求

 

抗病良種培育是我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)提質(zhì)增效的重要途徑。然而由于對(duì)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物抗病基因的功能及其調(diào)控機(jī)制的認(rèn)識(shí)不足,限制了水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物抗病分子育種的研究進(jìn)程,滿足不了水產(chǎn)業(yè)對(duì)抗病高產(chǎn)良種的需求。

 

(三)性別特異分子標(biāo)記和分子輔助性控技術(shù)研究滿足不了魚類養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展的需求

 

水產(chǎn)動(dòng)物中雌雄個(gè)體在產(chǎn)量性狀方面的性別差異非常普遍,因此性別控制育種和相關(guān)性別決定基礎(chǔ)研究是水產(chǎn)前沿技術(shù)研究的重要內(nèi)容。盡管目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)半滑舌鰨、黃顙魚、羅非魚、圓斑星鰈和條石鯛的性別特異分子標(biāo)記,并進(jìn)行了產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用,但是,在許多其他水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物尚未開發(fā)出性別特異分子標(biāo)記,分子性控育種研究也比較滯后。

 

(四)基因組選擇剛剛起步,離良種選育應(yīng)用尚有距離

 

基因組選擇將成為今后水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物育種的重要手段之一,但目前只在少數(shù)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物上進(jìn)行了前期研究,距離建立全基因組選擇育種技術(shù)并在產(chǎn)業(yè)中進(jìn)行應(yīng)用仍然有相當(dāng)距離,需要加大投入,重點(diǎn)突破。


 

四、水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展戰(zhàn)略與關(guān)鍵技術(shù)

 

(一)發(fā)展戰(zhàn)略

 

以服務(wù)于水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)戰(zhàn)略,提高現(xiàn)代漁業(yè)科技競(jìng)爭(zhēng)力為主要目標(biāo),加快水產(chǎn)生物技術(shù)的原始創(chuàng)新研究,圍繞水產(chǎn)重要經(jīng)濟(jì)物種基因組結(jié)構(gòu)和功能解析、經(jīng)濟(jì)性狀調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、基因組育種技術(shù)體系以及種質(zhì)資源評(píng)價(jià)與保護(hù),力爭(zhēng)在理論方面有重大發(fā)現(xiàn),在關(guān)鍵共性技術(shù)方面有所突破,支撐和引領(lǐng)水產(chǎn)種業(yè)發(fā)展,為建設(shè)水產(chǎn)生物技術(shù)強(qiáng)國(guó)、引領(lǐng)世界水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展、實(shí)現(xiàn)我國(guó)從水產(chǎn)養(yǎng)殖大國(guó)向水產(chǎn)養(yǎng)殖強(qiáng)國(guó)邁進(jìn)做出貢獻(xiàn)。

 

(二)關(guān)鍵技術(shù)

 

1. 水產(chǎn)生物高復(fù)雜度基因組的組裝和分析技術(shù)

 

水產(chǎn)生物高復(fù)雜度基因組的組裝和分析技術(shù)主要包括高雜合度、高重復(fù)序列水產(chǎn)生物的全基因組或性染色體基因組拼接、組裝及生物信息學(xué)分析技術(shù)。

 

2. 重要水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物基因組編輯技術(shù)

 

重要水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物基因組編輯技術(shù)主要包括水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物(魚、蝦、蟹、貝等)基因組編輯(轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶和 CRISPR/Cas9)技術(shù)以及基因組編輯平臺(tái)。

 

3. 水產(chǎn)動(dòng)物重要經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)鍵基因及分子標(biāo)記篩選與鑒定技術(shù)

 

水產(chǎn)動(dòng)物重要經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)鍵基因及分子標(biāo)記篩選與鑒定技術(shù)包括水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物生長(zhǎng)、抗病、性別決定等重要性狀相關(guān)分子標(biāo)記和關(guān)鍵基因的篩選與鑒定技術(shù)。

 

4. 水產(chǎn)動(dòng)物基因組選擇和分子設(shè)計(jì)技術(shù)

 

水產(chǎn)動(dòng)物基因組選擇和分子設(shè)計(jì)技術(shù)主要包括水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物抗病、抗逆和品質(zhì)性狀的全基因組選擇和分子設(shè)計(jì)技術(shù)。


五、水產(chǎn)生物技術(shù)發(fā)展建議

 

鑒于水產(chǎn)生物技術(shù)在我國(guó)水產(chǎn)種業(yè)和水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展中的重要意義和應(yīng)用潛力,考慮到國(guó)內(nèi)外目前的發(fā)展現(xiàn)狀和存在問(wèn)題,建議我國(guó)圍繞如下幾個(gè)方面設(shè)立重點(diǎn)研究計(jì)劃專項(xiàng)。

 

(一)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物全基因組結(jié)構(gòu)解析及基因資源的深度挖掘

 

進(jìn)行魚、蝦、貝、蟹、藻等重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物全基因組測(cè)序和精細(xì)圖譜構(gòu)建,分析不同水產(chǎn)生物基因組的結(jié)構(gòu)特征和進(jìn)化規(guī)律,闡釋不同水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因組的結(jié)構(gòu)和功能,進(jìn)行基因資源的深度挖掘。

 

(二)水產(chǎn)養(yǎng)殖生物重要經(jīng)濟(jì)性狀的遺傳解析及分子設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)研究

 

建立水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因組編輯公共平臺(tái)和技術(shù)體系,篩選重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物生長(zhǎng)、抗病、性別、環(huán)境適應(yīng)等性狀關(guān)鍵基因;開展抗病、抗逆和品質(zhì)性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析和基因組選擇及分子設(shè)計(jì)的基礎(chǔ)研究;構(gòu)建水產(chǎn)養(yǎng)殖生物重要基因高效重組表達(dá)技術(shù)體系,研制基因工程重組蛋白;探索重組表達(dá)產(chǎn)物提高水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物生長(zhǎng)速率和抗病力的途徑。

 

(三)重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物經(jīng)濟(jì)性狀形成的表觀遺傳與環(huán)境調(diào)控機(jī)制

 

以水產(chǎn)養(yǎng)殖生物生長(zhǎng)、生殖、發(fā)育和免疫等重要經(jīng)濟(jì)性狀為目標(biāo)性狀,通過(guò)基因組甲基化分析、組蛋白修飾以及小核糖核酸(RNA)分析等技術(shù)手段解析環(huán)境因素介導(dǎo)的重要經(jīng)濟(jì)性狀形成的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制;建立甲基化修飾因子在水產(chǎn)動(dòng)物中的檢測(cè)技術(shù)體系,篩選與重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的表觀標(biāo)記。

 

(四)重要水產(chǎn)養(yǎng)殖生物基因信息大數(shù)據(jù)平臺(tái)構(gòu)建及應(yīng)用

 

構(gòu)建以種質(zhì)資源數(shù)據(jù)和基因組數(shù)據(jù)為核心的水產(chǎn)生物基因資源信息大數(shù)據(jù)平臺(tái),收集、儲(chǔ)存和分析我國(guó)重要水產(chǎn)養(yǎng)殖物種豐富多樣的種質(zhì)資源和基因資源信息;通過(guò)數(shù)據(jù)的加工和大數(shù)據(jù)分析,為水產(chǎn)生物技術(shù)研發(fā)、遺傳育種、病害防治和資源保護(hù)等提供必要的數(shù)據(jù)支撐。

 

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