首先大家先了解什么是挖數(shù)據(jù)（點(diǎn)我）

我叫林平之，是一個挖掘機(jī)駕駛員，不，應(yīng)該是莫愁師姐的師弟，呃，有一個小小的問題一直困擾著我。就是要怎么分析別人家的芯片。GEO雖然好，但感覺Datasets上的芯片真的很少，根本不夠用的呢，那要咋辦？

莫愁：那就上Array Express上去咯，我很大方地把網(wǎng)址也交給你吧，就是這個網(wǎng)址：

http://www./arrayexpress/

打開后是這個樣子：

和GEO差不多，就是隨便搜搜，就能得到一堆，當(dāng)然，它會對搜索的關(guān)鍵詞進(jìn)行一個細(xì)分，差不多會是這樣，那我們就搜一個腸癌看看：

搜索到之后，點(diǎn)擊一下最右邊的Atlas，這樣就可以利用其中的圖形分析的小工具了。隨便選一個腸癌的芯片吧，芯片編號就是E-MEXP-3715。

點(diǎn)擊進(jìn)去，差不多是下面這個界面，和GEO差不多，也有一個這樣的小工具，可以直接進(jìn)行分析處理，也能下載分析獲得的結(jié)果，當(dāng)然這并不是我要用的。因?yàn)檫@個分析的比較樣本選擇性較差，就只有一兩種選擇。

那我們要如何下載這個芯片的數(shù)據(jù)呢？首先要點(diǎn)擊這個紅色的“Experiment design”，等頁面跳出來之后，再點(diǎn)擊藍(lán)色的下載按鈕，否則是下載不了的哦。

存到你的盤里，老司機(jī)只剩下0.9G了……

會下載到一個挺大的“.tsv”文件，是一個表格文件。

然后打開神器（跟我唱：不要問，不要說，一切盡在不言中。這一刻，偎著燭光讓我們靜靜的渡過。莫揮手，莫回頭，當(dāng)我唱起這首歌，怕只怕淚水輕輕的滑落……不知道的，或許能在你們的收藏夾里找到，因?yàn)槲乙矊?shí)在不記得是哪個帖子了）

打開后，點(diǎn)擊下拉菜單“File”，選擇“Open File…”，記住，這次不是GEO的那種Import文件了。

導(dǎo)入后會讓你選擇表格的數(shù)據(jù)分類，因?yàn)檫@個表格沒啥屬性，所以要你自己選擇哪個是數(shù)據(jù)，哪個是行，哪個是列。鼠標(biāo)點(diǎn)擊后會有顏色區(qū)分，這個應(yīng)該不用我來教你咋分了吧……

輸入后會顯示出芯片的熱圖，然后要對這個熱圖來進(jìn)行進(jìn)一步的分析。就點(diǎn)上面這個按鈕。

中間是分組條件，有的芯片命名有規(guī)則，有的沒有，具體要看剛才的“Experiment design”界面里對樣品的描述了。這里就選癌和癌旁就可以進(jìn)行分析了。

然后就是稍微有點(diǎn)漫長的等待，畢竟樣品多，基因多……

接著就可以直接出現(xiàn)結(jié)果了：

做完這個，我覺得我胸前的紅領(lǐng)巾更鮮艷了呢……

…華麗麗的分割線…

李莫愁博士：話說這個神器我是已經(jīng)介紹過好幾遍了，不過我也真的是不記得在哪個帖子里了，也不記得應(yīng)該回復(fù)啥才能得到這個軟件了。大家要是有興趣的話，可以去自己的收藏夾里找找看，除此之外就看你們運(yùn)氣了。不過估計翻起來也麻煩……好了，今天就先策到這里吧。