福建省（15個(gè)）福建武夷山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建將樂(lè)龍棲山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建天寶巖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建深滬灣海底古森林遺跡國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建漳江口紅樹(shù)林國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建虎伯寮國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建廈門(mén)珍稀海洋物種國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建梁野山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建梅花山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建戴云山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建閩江源國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建君子峰國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建南平茫蕩山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、福建福州閩江河口濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日）、福建茫蕩山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日）

華中地區(qū)

河南省（11個(gè)）河南黃河濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南豫北黃河故道濕地鳥(niǎo)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南焦作太行山獼猴國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南南陽(yáng)恐龍蛋化石群國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南伏牛山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南寶天曼國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南雞公山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南董寨國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南連康山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南小秦嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、河南丹江濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

湖北省（13個(gè)）湖北青龍山恐龍蛋化石群國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北神農(nóng)架國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北五峰后河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北石首麋鹿國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北長(zhǎng)江天鵝洲白鱀豚國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北長(zhǎng)江新螺段白鱀豚國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北星斗山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北九宮山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北七姊妹山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北洪湖濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北龍感湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北賽武當(dāng)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北木林子國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖北堵河源國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）、十八里長(zhǎng)峽國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

湖南省（23個(gè)）湖南炎陵桃源洞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南東洞庭湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南壺瓶山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南張家界大鯢國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南八大公山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南莽山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南永州都龐嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南小溪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南黃桑國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南烏云界國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南鷹嘴界國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南南岳衡山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南借母溪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南八面山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南陽(yáng)明山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南六步溪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南舜皇山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南高望界國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、湖南東安舜皇山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）、湖南白云山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）[4] 、湖南西洞庭湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、九嶷山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、金童山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

華南地區(qū)

廣東省（12個(gè)）廣東南嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東車八嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東丹霞山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東內(nèi)伶仃島-福田國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東珠江口中華白海豚國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東湛江紅樹(shù)林國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東鼎湖山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東象頭山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東惠東港口海龜國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東徐聞珊瑚礁國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東雷州珍稀水生動(dòng)物國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣東羅坑鱷蜥國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）

廣西壯族自治區(qū)（16個(gè)）廣西大明山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西花坪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西貓兒山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西山口紅樹(shù)林生態(tài)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西合浦營(yíng)盤(pán)港-英羅港儒艮國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西北侖河口國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西防城金花茶國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西十萬(wàn)大山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西弄崗國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西大瑤山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西木論國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西千家洞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西岑王老山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西九萬(wàn)山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西金鐘山黑頸長(zhǎng)尾雉國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西崇左白頭葉猴自然保護(hù)區(qū)、廣西大桂山鱷蜥國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）[4] 、廣西邦亮長(zhǎng)臂猿國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、恩城國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、廣西元寶山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年12月25日

海南省（9個(gè)）海南三亞珊瑚礁國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南東寨港國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南銅鼓嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南大洲島海洋生態(tài)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南大田國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南尖峰嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南五指山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南壩王嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、海南吊羅山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

西南地區(qū)

重慶市（7個(gè)）重慶縉云山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、重慶大巴山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、長(zhǎng)江上游珍稀特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)*、重慶金佛山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、雪寶山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、重慶陰條嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、重慶五里坡國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日）

四川省（26個(gè)）四川龍溪－虹口國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川白水河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川攀枝花蘇鐵國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川畫(huà)稿溪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川王朗國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川廣元唐家河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川馬邊大風(fēng)頂國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川長(zhǎng)寧竹海國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川蜂桶寨國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川臥龍國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（直屬國(guó)家林業(yè)局；范圍同四川省汶川臥龍?zhí)貏e行政區(qū)）、四川九寨溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川小金四姑娘山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川若爾蓋濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川貢嘎山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川察青松多白唇鹿國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川亞丁國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川美姑大風(fēng)頂國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、長(zhǎng)江上游珍稀特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川廣元米倉(cāng)山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川雪寶頂國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川花萼山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川海子山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、諾水河珍稀水生動(dòng)物國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、黑竹溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、格西溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、四川小寨子溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日） 、栗子坪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

貴州省（9個(gè)）貴州習(xí)水中亞熱帶常綠闊葉林國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州赤水桫欏國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州梵凈山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州麻陽(yáng)河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、長(zhǎng)江上游珍稀特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)*、貴州草海國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州雷公山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州茂蘭國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、貴州寬闊水國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

云南省（17個(gè)）云南哀牢山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南高黎貢山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南大山包黑頸鶴國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南大圍山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南金平分水嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南黃連山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南文山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南無(wú)量山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南西雙版納國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南西雙版納納版河流域國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南蒼山洱海國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南白馬雪山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南南滾河國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、長(zhǎng)江上游珍稀特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南藥山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南會(huì)澤黑頸鶴國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、云南永德大雪山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、烏蒙山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

青藏地區(qū)

青海省（7個(gè)）青海孟達(dá)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、青海青海湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、青?？煽晌骼飮?guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、青海隆寶國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、青海三江源國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、青海柴達(dá)木梭梭林國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日）、大通北川河源區(qū)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013-12-25）

西藏自治區(qū)（9個(gè)）西藏雅魯藏布江中游河谷黑頸鶴國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏芒康滇金絲猴國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏珠穆朗瑪峰國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏色林錯(cuò)國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏羌塘國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏雅魯藏布大峽谷國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏察隅慈巴溝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏拉魯濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、西藏類烏齊馬鹿國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

西北地區(qū)

陜西省（19個(gè)）陜西周至國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西太白山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西長(zhǎng)青國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西佛坪國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西牛背梁國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西漢中朱鹮國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西子午嶺國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西化龍山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西天華山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西青木川國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西桑園國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西米倉(cāng)山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西隴縣秦嶺細(xì)鱗鮭國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西韓城褐馬雞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西漢中略陽(yáng)大鯢國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西觀音山國(guó)家級(jí)級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西省略陽(yáng)珍稀水生動(dòng)物國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日）、陜西黃柏塬國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日）、陜西平河梁國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) （2013年6月4日） 、老縣城國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、陜西觀音山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013-01-24）

甘肅省（14個(gè)）甘肅興隆山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅祁連山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅敦煌西湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅安西極旱荒漠國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅民勤連古城國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅白水江國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅蓮花山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅尕海－則岔國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅太統(tǒng)-崆峒山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅連城國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅小隴山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅鹽池灣國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅安南壩野駱駝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、甘肅漳縣珍稀水生動(dòng)物國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日） 、黃河首曲國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

寧夏回族自治區(qū)（6個(gè)）寧夏賀蘭山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏沙坡頭國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏羅山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏靈武白芨灘國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏六盤(pán)山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏哈巴湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、寧夏云霧山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)（2013年6月4日） 、火石寨丹霞地貌國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)

新疆自治區(qū)（9個(gè)）新疆阿爾金山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆羅布泊野駱駝國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆巴音布魯克國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆托木爾峰國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆西天山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆甘家湖梭梭林國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆喀納斯國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆塔里木胡楊國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)、新疆艾比湖濕地國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)  、布爾根河貍國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)