根據(jù)生產(chǎn)企業(yè)出口退稅的計(jì)算原理，生產(chǎn)企業(yè)購進(jìn)原材料、零部件、燃料、動(dòng)力等進(jìn)項(xiàng)稅額需要統(tǒng)一參與“免、抵、退”計(jì)算中，簡而言之，生產(chǎn)企業(yè)當(dāng)期全部進(jìn)項(xiàng)稅額首先需抵頂內(nèi)銷貨物銷項(xiàng)稅額，抵頂后，如有進(jìn)項(xiàng)稅額留抵額，再按規(guī)定計(jì)算限額退還給納稅人。因此，生產(chǎn)企業(yè)在生產(chǎn)經(jīng)營中支付的款項(xiàng)若取得合規(guī)增值稅抵扣憑證的，如增值稅專用發(fā)票、海關(guān)完稅憑證等，均應(yīng)認(rèn)證申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

“營改增”試點(diǎn)后，生產(chǎn)型出口企業(yè)如果以離岸價(jià)報(bào)關(guān)出口，即簽訂銷售合同時(shí)，約定海運(yùn)費(fèi)由國外客戶自行承擔(dān)，合同貨款不含海運(yùn)費(fèi)，因海運(yùn)費(fèi)由國外客戶自行承擔(dān)，生產(chǎn)企業(yè)先行支付的海運(yùn)費(fèi)，只是代墊行為，賬務(wù)上應(yīng)作為往來款項(xiàng)處理。此種情況下，生產(chǎn)型出口企業(yè)即使取得貨代公司開具的貨代增值稅專用發(fā)票，也不得參與“免、抵、退”計(jì)算，即不得認(rèn)證申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

如果以到岸價(jià)報(bào)關(guān)出口，即簽訂銷售合同時(shí)，約定海運(yùn)費(fèi)由出口企業(yè)承擔(dān)，此時(shí)合同定價(jià)當(dāng)然包含相應(yīng)的海運(yùn)費(fèi)。例如：2013年9月某化工企業(yè)與國外客戶簽訂貨物銷售合同，合同約定該化工企業(yè)負(fù)責(zé)將貨物運(yùn)輸至國外客戶碼頭，交貨地為國外客戶碼頭，以到岸價(jià)報(bào)關(guān)出口，總貨款10000萬美元（其中含海運(yùn)收費(fèi)100萬美元），該化工企業(yè)實(shí)際支付給貨代公司海運(yùn)代理費(fèi)80萬美元，假設(shè)匯率為6.17。此種情況下，收取的100萬美元海運(yùn)費(fèi)構(gòu)成合同金額的一部分。

根據(jù)增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則和《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于在全國開展交通運(yùn)輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務(wù)業(yè)營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)稅收政策的通知》及其他相關(guān)規(guī)定，增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額不得抵扣項(xiàng)目采用正列舉，也就是說，不在列舉不得抵扣范圍的，企業(yè)只要取得合規(guī)增值稅抵扣憑證的，均可申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額?！盃I改增”試點(diǎn)后，貨物運(yùn)輸代理公司收取的上述80萬美元貨物運(yùn)輸代理收入已申報(bào)繳納增值稅，從增值稅抵扣鏈條的完整性分析，作為下游出口企業(yè)，其支付的80萬美元貨代費(fèi)用，若取得貨代公司開具的國際貨代專票，該支出不屬于稅收政策規(guī)定的不可抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的范圍，應(yīng)允許參與“免、抵、退”計(jì)算，即可認(rèn)證申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。