公安機關在偵查中存在的問題主要表現(xiàn)在以下幾方面：

　　1、搜集證據(jù)不及時，證據(jù)固定不到位。在審查起訴工作中，一些質量不高的案件，都是由于案發(fā)當時偵查工作不細、證據(jù)搜集不及時、證據(jù)固定不到位造成的，最終導致案件事實不清、證據(jù)不足，難以訴訟。一是對犯罪嫌疑人的訊問過于簡單，關鍵情節(jié)訊問不到位，有的案件偵查過程中只對犯罪嫌疑人訊問1—2次，特別是普遍存在著對犯罪嫌疑人逮捕后24小時內(nèi)的訊問流于形式，不能抓住案件的關鍵情節(jié)反復訊問，進一步固定口供。導致案件在以后的訊問中嫌疑人反供，影響到案件事實和性質的認定。二是證據(jù)搜集不及時，固定不到位。經(jīng)審查一些事實不清、證據(jù)不足，法院下判難度大的案件，其原因均是由于公安機關偵查過程中取證不及時、證據(jù)固定不到位造成的，案發(fā)當時該及時搜集的證據(jù)收搜不及時，取證不及時或不到位，特別是有些關鍵證據(jù)由于搜集不及時，因時過境遷而無法彌補，造成案件難以訴訟的后果。三是偵查人員責任心不強，對已搜集到的重要證據(jù)因保管不慎丟失，直接影響案件的認定。

　　2、刑事技術工作質量不高。在工作實踐中，確實存在著個別案件因刑事技術工作不到位，導致案件難以訴訟的情況。一是現(xiàn)場勘查不細或無現(xiàn)場勘查。如張成幫殺人案，現(xiàn)場遺留的黑鞋帶和綠布條，現(xiàn)場勘查與拍照關于鞋帶和布條的位置存在很大矛盾，使審查案件無法認定遺留現(xiàn)場物證的準確位置。二是在具體案件中搞辨認時指認的多，辨認的少，辨認不按程序操作，使辨認得來的證據(jù)準確性不強。三是刑事技術鑒定書敘述不細。如陳冬冬傷害案，陳辯解他是在被害人騎在其身上打他的情況下，從腰間掏出刀捅的被害人的腹部，因案發(fā)當時沒有在場的其他人，被害人又已死亡，那么陳辯解的這一情節(jié)就尤為重要，直接涉及到本案是定性故意傷害還是正當防衛(wèi)的問題。要弄清這個問題的關鍵就是要依賴于法醫(yī)鑒定，但恰恰法醫(yī)鑒定未敘述被害人傷口的走向和角度，給準確定案帶來了不應有的困難。

　　3、偵查活動存在著程序違法的問題。公安機關在偵查活動中在某種程度上存在著重實體輕程序的問題。在有些案件中，有違反程序辦案的情況。具體表現(xiàn)在：存在著一人訊問或詢問的問題。在筆錄中表現(xiàn)為同一時間、同一偵查人員同時對二名犯罪嫌疑人或證人進行訊問、詢問的情況;存在著一名技術人員進行尸檢的情況;存在著拘留超時限和對犯罪嫌疑人刑拘或逮捕后24小時不及時訊問的情況;個別案件存在著對犯罪嫌疑人引供誘供，刑訊逼供的情況;存在著違反規(guī)定采取取保侯審以及對被取保侯審的犯罪嫌疑人監(jiān)管不力，辦案單位不能及時掌握被取保人的活動的情況，導致審查機關辦案中找不到被取保人，給刑事訴訟帶來困難。

　　檢察機關在審查案件中也存在質量不高的問題。主要體現(xiàn)在：公訴干警責任心不強，對案卷材料審查不細，把關不嚴，導致個別案件起訴后法院以事實不清、證據(jù)不足判無罪;訊問被告人過于簡單，關鍵情節(jié)訊問不到位;對侵權案件應當復核被害人和關鍵證人不復核或復核不到位;退補質量不高，退補問題要求的不全、不細，退補提綱不規(guī)范，一些案件完全可以一次退補就能解決問題，但由于質量不高，導致不必要的二次等問題。