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ANGEW CHEM INT EDIT:新實驗技術(shù)捕獲microRNA靶標(biāo)

 雪城狼 2012-05-14

眾所周知,人類細(xì)胞可產(chǎn)生成千上萬個不同的microRNA(miRNAs),其中miRNAs是些小片段遺傳物質(zhì),有助于確定特定時間打開或關(guān)閉哪一個基因。miRNAs是正常細(xì)胞功能的一個重要部分,但能促發(fā)人類疾病,如:特定腫瘤內(nèi)的一些miRNAs被升高,則會促進細(xì)胞存活。為了更好地了解miRNAs如何影響健康與疾病,研究人員首先必須知道哪一個miRNAs作用于哪一個基因,考慮到miRNAs絕對數(shù)量與單個miRNA調(diào)控成百上千個基因的事實,這是一個很大的挑戰(zhàn)。現(xiàn)在,有一種名為miR-TRAP的新方法問世,它使用方便,可直接鑒定細(xì)胞內(nèi)miRNA靶標(biāo)。

與現(xiàn)有鑒定miRNA靶標(biāo)的方法相比,miR-TRAP更簡單、更精確,主要理由有3個,分別是:首先,miR-TRAP可直接鑒定正常或疾病情況下活體細(xì)胞內(nèi)的miRNA靶標(biāo);其次,不僅能識別出被miRNAs減少的mRNA靶標(biāo),也能識別翻譯被抑制的蛋白質(zhì)靶標(biāo),這一靶標(biāo)通常不能被其他技術(shù)檢測出來,如熒光定量PCR或芯片分析;第三,不依賴于抗體,因為抗體能導(dǎo)致非特異性背景信號和復(fù)雜數(shù)據(jù)解釋。通過對2個重要miRNAs的13個預(yù)測靶標(biāo)的分析,這項技術(shù)不但確認(rèn)了已知的基因靶標(biāo),還揭示了2個新靶標(biāo)。(生物谷bioon.com)

miR-TRAP: A Benchtop Chemical Biology Strategy to Identify microRNA Targets

Huricha Baigude, Ahsanullah, Zhonghan Li, Ying Zhou, Tariq M. Rana

It′s a TRAP! microRNAs (miRNAs) are noncoding small RNAs that consist of approximately 21 nucleotides and are assembled into an RNA-induced silencing complex (RISC), which suppresses target mRNA expression. An easy-to-use method called miRNA target RNA affinity purification (miR-TRAP) directly identifies miRNA targets in vivo. This method could be widely used to discover miRNA targets in various disease models under physiological conditions.

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