氣-質聯(lián)用 
GC/MS被廣泛應用于復雜組分的分離與鑒定，其具有GC的高分辨率和質譜的高靈敏度，是生物樣品中藥物與代謝物定性定量的有效工具。 


質譜儀的基本部件有：離子源、濾質器、檢測器三部分組成，它們被安放在真空總管道內。 接口：由GC出來的樣品通過接口進入到質譜儀，接口是色質聯(lián)用系統(tǒng)的關鍵。 
l接口作用： 
l壓力匹配——質譜離子源的真空度在10-3Pa，而GC色譜柱出口壓力高達105Pa，接口的作用就是要使兩者壓力匹配。 
l組分濃縮——從GC色譜柱流出的氣體中有大量載氣，接口的作用是排除載氣，使被測物濃縮后進入離子源。 
常見接口技術有： 
l分子分離器連接 （主要用于填充柱） 
l擴散型——擴散速率與物質分子量的平方成反比，與其分壓成正比。當色譜流出物經過分離器時，小分子的載氣易從微孔中擴散出去，被真空泵抽除，而被測物分子量大，不易擴散則得到濃縮。 
l直接連接法（主要用于毛細管柱） 
l在色譜柱和離子源之間用長約50cm，內徑0.5mm的不銹鋼毛細管連接，色譜流出物經過毛細管全部進入離子源，這種接口技術樣品利用率高。 
l開口分流連接 
l該接口是放空一部分色譜流出物，讓另一部分進入質譜儀，通過不斷流入清洗氦氣，將多余流出物帶走。此法樣品利用率低。 
離子源 
離子源的作用是接受樣品產生離子，常用的離子化方式有： 
l電子轟擊離子化（electron impact ionization，EI） 
lEI是最常用的一種離子源，有機分子被一束電子流（能量一般為70eV）轟擊，失去一個外層電子，形成帶正電荷的分子離子（M+ ） ， M+進一步碎裂成各種碎片離子、中性離子或游離基，在電場作用下，正離子被加速、聚焦、進入質量分析器分析。 
lEI特點： 
l電離效率高，能量分散小，結構簡單，操作方便。 
l圖譜具有特征性，化合物分子碎裂大，能提供較多信息，對化合物的鑒別和結構解析十分有利。 
l所得分子離子峰不強，有時不能識別。 
l本法不適合于高分子量和熱不穩(wěn)定的化合物。 

l化學離子化（chemical ionization，CI） 
l將反應氣（甲烷、異丁烷、氨氣等）與樣品按一定比例混合，然后進行電子轟擊，甲烷分子先被電離，形成一次、二次離子，這些離子再與 樣品分子發(fā)生反應，形成比樣品分子大一個質量數(shù)的（M+1） 離子，或稱為準分子離子。準分子離子也可能失去一個H2 ，形成（M-1）離子。 
lCI 特點 
l不會發(fā)生象EI中那么強的能量交換，較少發(fā)生化學鍵斷裂，譜形簡單。 
l 分子離子峰弱，但（M+1） 峰強，這提供了分子量信息。 

場致離子化（field ionization，F(xiàn)I） 
l適用于易變分子的離子化，如碳水化合物、氨基酸、多肽、抗生素、苯丙胺類等。能產生較強的分子離子峰和準分子離子峰。 場解吸離子化（ field desorption ionization， FD） 
l用于極性大、難氣化、對熱不穩(wěn)定的化合物。 負離子化學離子化（negative ion chemical ionization，NICI） 
l是在正離子MS的基礎上發(fā)展起來的一種離子化方法，其給出特征的負離子峰，具有很高的靈敏度（ 10-15 g）。 


質量分析器 
其作用是將電離室中生成的離子按質荷比（m/z）大小分開，進行質譜檢測。常見質量分析器有 
l四極質量分析器（quadrupole analyzer） 
l原理：由四根平行圓柱形電極組成，電極分為兩組，分別加上直流電壓和一定頻率的交流電壓。樣品離子沿電極間軸向進入電場后，在極性相反的電極間振蕩，只有質荷比在某個范圍的離子才能通過四極桿，到達檢測器，其余離子因振幅過大與電極碰撞，放電中和后被抽走。因此，改變電壓或頻率，可使不同質荷比的離子依次到達檢測器，被分離檢測。 
扇形質量分析器 
l磁式扇形質量分析器（magnetic-sector mass analyzer） 
l被電場加速的離子進入磁場后，運動軌道彎曲了，離子軌道偏轉可用公式表示： 
l 
l當H，V一定時，只有某一質荷比的離子能通過狹縫到達檢測器。 
l特點：分辨率低，對質量同、能量不同的離子分辨較困難。 

l雙聚焦質量分析器（double-focusing mass assay） 
l由一個靜電分析器和一個磁分析器組成，靜電分析器允許有某個能量的離子通過，并按不同能量聚焦，先后進入磁分析器，經過兩次聚焦，大大提高了分辨率。 
l離子阱檢測器（ion trap detector） 
l原理類似于四極分析器，但讓離子貯存于井中，改變電極電壓，使離子向上、下兩端運動，通過底端小孔進入檢測器。 

檢測器 
檢測器的作用是將離子束轉變成電信號，并將信號放大，常用檢測器是電子倍增器。當離子撞擊到檢測器時引起倍增器電極表面噴射出一些電子，被噴射出的電子由于電位差被加速射向第二個倍增器電極，噴射出更多的電子，由此連續(xù)作用，每個電子碰撞下一個電極時能噴射出2-3個電子，通常電子倍增器有14級倍增器電極，可大大提高檢測靈敏度。 

GC-MS的常用測定方法l總離子流色譜法（total ionization chromatography，TIC）—— 類似于GC 圖譜，用于定量。l反復掃描法（repetitive scanning method，RSM）——按一定間隔時間反復掃描，自動測量、運算，制得各個組分的質譜圖，可進行定性。l質量色譜法（mass chromatography，MC）——記錄具有某質荷比的離子強度隨時間變化圖譜。在選定的質量范圍內，任何一個質量數(shù)都有與總離子流色譜圖相似的質量色譜圖。 
l 
選擇性離子監(jiān)測（selected ion monitoring，SIM）—— 對選定的某個或數(shù)個特征質量峰進行單離子或多離子檢測，獲得這些離子流強度隨時間的變化曲線。其檢測靈敏度較總離子流檢測高2-3個數(shù)量級。 

質譜圖——為帶正電荷的離子碎片質荷比與其相對強度之間關系的棒圖。質譜圖中最強峰稱為基峰，其強度規(guī)定為100%，其它峰以此峰為準，確定其相對強度。

容積延遲：針對溶劑的揮發(fā)性設定開啟MS燈絲的時間，如果開啟過早的話，溶劑含量過高容易燒斷燈絲；開啟過晚的話容易導致RT小的被測組分被漏檢！在待測物出峰之前的一定時間內，可以不開檢測器，這段時間應該就是延遲時間。目的是為了切除溶劑，保護檢測器，延長檢測器壽命。如果延遲時間和檢測時間相同，會有瞬間高電流。

分流進樣是一種汽化進樣方法。樣品汽化后和載氣混合，然后氣流分為兩路，分別進入柱內和排人大氣，后者由流量控制閥控制。通常控制注射的樣品量為O．1～2μl。分流比(進入柱內的流量與排空流量的比)為1：10到1：1000之間。常用的分流比范圍為1：20到1：20O之間。

有些化合物極性太強，在加熱過程中易分解，例如有機酸類化合物，此時可以進行酯化處理，將酸變?yōu)轷ピ龠M行GC-MS分析，由分析結果可以推測酸的結構。如果樣品不能汽化也不能酯化，那就只能進行LC-MS分析了。進行LC-MS分析的樣品最好是水溶液或甲醇溶液，LC流動相中不應含不揮發(fā)鹽。對于極性樣品,一般采用ESI源，對于非極性樣品,采用APCI源。