對于一般納稅人丟失已開具專用發(fā)票的發(fā)票聯(lián)和抵扣聯(lián)，有兩種情況需要注意：

　　1、丟失前已認證相符的，購買方憑銷售方提供的相應專用發(fā)票記賬聯(lián)復印件及銷售方所在地主管稅務機關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報稅證明單》，經(jīng)購買方主管稅務機關(guān)審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。

　　2、丟失前未認證的，購買方憑銷售方提供的相應專用發(fā)票記賬聯(lián)復印件到主管稅務機關(guān)進行認證，認證相符的憑該專用發(fā)票記賬聯(lián)復印件及銷售方所在地主管稅務機關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報稅證明單》，經(jīng)購買方主管稅務機關(guān)審核同意后，可作為增值稅進項稅額的抵扣憑證。

　　另外，根據(jù)國稅函[2010]162號文件規(guī)定，對于外貿(mào)企業(yè)丟失已開具增值稅專用發(fā)票發(fā)票聯(lián)和抵扣聯(lián)的，在增值稅專用發(fā)票認證相符后，可憑增值稅專用發(fā)票記賬聯(lián)復印件及銷售方所在地主管稅務機關(guān)出具的《丟失增值稅專用發(fā)票已報稅證明單》，經(jīng)購買方主管稅務機關(guān)審核同意后，向主管出口退稅的稅務機關(guān)申報出口退稅。國稅函[2010]162號文件首次明確在丟失已開具增值稅專用發(fā)票發(fā)票聯(lián)和抵扣聯(lián)的情況下，通過認證相符記賬聯(lián)可以作為外貿(mào)企業(yè)申報并計算出口退稅的依據(jù)。

　　滯留發(fā)票產(chǎn)生的原因有哪些

　　滯留發(fā)票一般是銷貨方對購貨方開具增值稅專用發(fā)票，而購貨方由于種種原因在規(guī)定期限內(nèi)(180日)未將專用發(fā)票認證及抵扣的增值稅專用發(fā)票。增值稅發(fā)票只要一經(jīng)防偽稅控系統(tǒng)開出，而購貨方未去認證則該發(fā)票就沒有對應的抵扣信息，就會造成滯留。那么，哪些原因?qū)е铝藴舭l(fā)票的產(chǎn)生呢?中華會計網(wǎng)校小編對這一問題的產(chǎn)生進行了總結(jié)和梳理，即，滯留發(fā)票產(chǎn)生的原因主要包括：

　　1.屬于購進免稅貨物用，專用發(fā)票不得認證;

　　2.屬于購進非應稅項目用，專用發(fā)票不得認證;

　　3.銷貨方未將專用發(fā)票交給購貨方，造成存根聯(lián)滯留;

　　4.購貨方接到專用發(fā)票超過180日認證期而無法認證抵扣，造成存根聯(lián)滯留;

　　5.購貨方在小規(guī)模納稅人期間取得對方開具的專用發(fā)票不能抵扣;

　　6.購貨方發(fā)生走逃或注銷。

　　對于上述問題，在實際操作中，各地稅局會要求存在滯留發(fā)票的公司必須對滯留的原因加以說明，同時也會對存在疑點的公司進行現(xiàn)場檢查。有些公司存在滯留發(fā)票，目的是想偷漏稅，隱瞞銷售收入同時隱瞞抵扣發(fā)票，使稅負從表面上看與正常公司相符，這就造成很多該抵扣的發(fā)票不去稅局抵扣，造成發(fā)票滯留。一般情況下，增值稅專用票的稅務管理很嚴格，稅局一旦發(fā)現(xiàn)問題會予以追究。