慢性結腸炎的診斷較為復雜，常常要進行反復排除性檢查才能正確診斷。
治療宜中西結合，辨證論治
飲食方面：1、注意補充蛋白質及維生素。飲食應選用易消化的優(yōu)質蛋白質食品，如魚、蛋、豆制品及富含維生素的新鮮嫩葉菜等。最好食用菜汁，以減少纖維的攝入。因為慢性結腸炎病人消化吸收功能差，應采用易消化半流少渣飲食，少量多餐，以增加營養(yǎng)，改善癥狀。
2、少纖維、低脂肪食物有促進腸蠕動，刺激腸壁作用，但不易消化，對腸道不利，故應限制。多油及脂肪類食物，除不易消化外，其滑腸作用可使腹瀉加重，所以炸、煎及肥肉應少吃。
3、應少食糖及易產氣的食物，如薯類、豆類、牛奶等。
4、更應注意飲食衛(wèi)生，不吃生冷、堅硬及變質食物，禁酒及辛辣刺激性強的調味品
5、可經常使用食用菌類，雪耳、木耳、冬菇、靈芝等提高免疫力。
6、民間用姜茶治痢疾，有雙向免疫作用。

治療：
一：西藥：
西藥有柳氮磺吡啶、糖皮質激素、免疫抑制劑。近年研制成的5-ASA特殊制劑巴柳氮，用偶氮鍵結合5-ASA制成的巴柳氮，在結腸內分解釋放大量有效成份從而起到哪病治哪提高療效，減少副作用，缺點是價格昂貴。奧瑞欣-巴柳氮鈉，給患有結腸炎、結腸潰瘍、局限性腸炎的患者更新更多的選擇。
(1)柳氮磺胺吡碇（SASP）：
本藥在腸道內分解為5-氨基水楊酸（5-ASA）與碘胺吡碇，前者是主要有效成分，能抑制黃嘌呤氧化酶或白細胞介導的氧自由基形成，能消除炎癥。
(2)甲硝唑：
主要用于各種厭氧菌感染、阿米巴病及絲蟲病等。
口服，成人每次0.4克，每日3-4次，用15日為1療程。靜滴：成人每次0.5-1.0克，分2次
(3)激素類（具體藥物有：氫化可的松、強的松、地塞米松等）：
此類藥物可減少白三烯B4的釋出，抑制其中性粒細胞的趨化作用，防止氧自由基的形成。
(4)硫唑嘌呤
此類藥物在體內產生硫嘌呤而發(fā)揮免疫抑制作用，抑制蛋白質的合成和淋巴細胞的增殖，對T淋巴細胞的抑制作用較強。

(5)奧瑞欣——巴柳氮鈉膠囊成功應用英國Astra Salix原裝高分子膜包裹技術，形成5-ASA微粒制劑。 向釋放藥物在炎癥部位，百分之百發(fā)揮藥效無損耗，減少對身體的不良反應。 不溶于胃酸，保持有效活性進入結腸是唯一有效抑制結腸炎及潰瘍致病因子的藥品（花生四烯酸的代謝產物）起到強大的抗炎作用，消除炎癥根源。能夠消除氧自由基的藥品，改善腸道功能，恢復炎癥潰瘍面，與殺菌作用合二為一，消炎修復雙管齊下。