2003年SARS的爆發(fā)，暴露了傳染病監(jiān)測和報告存在的問題。國務(wù)院衛(wèi)生部明確提出建立暢通的疫情信息網(wǎng)絡(luò)。要利用現(xiàn)代通信手段，在全國建立統(tǒng)一、高效、快速、準(zhǔn)確的疫情報告系統(tǒng); 形成縱橫貫通的信息報告網(wǎng)絡(luò); 協(xié)助地方完善衛(wèi)生信息網(wǎng)絡(luò)與醫(yī)療機(jī)構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)互聯(lián)互通等工作，制定疫情和突發(fā)公共衛(wèi)生信 息發(fā)布制度，根據(jù)需要向社會及時發(fā)布，增強人們的預(yù)防意識，督促各地區(qū)采取積極的應(yīng)對措施。

    2003年11月建成國家疾病監(jiān)測數(shù)據(jù)中心機(jī)房。2004年1月1日正式啟動基礎(chǔ)疫情報告系統(tǒng)，全國93%縣級及以上醫(yī)院,43%鄉(xiāng)鎮(zhèn)衛(wèi)生院從網(wǎng)上報告疫情,平均每日約有5000用戶上網(wǎng)直報，全年共有412.4萬傳染病個案從網(wǎng)上報告，全國每分鐘會有3張傳染病報告卡通過網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行直報，每日平均產(chǎn)生1萬多監(jiān)測病例的個案信息; 2004年4月26日正式啟動醫(yī)院死因報告系統(tǒng)，共有40萬死亡案例經(jīng)網(wǎng)上報告,估計占全國死亡的8.9%; 2005年1月啟動的結(jié)核病專病報告系統(tǒng), 使結(jié)核追蹤、治療信息和全國結(jié)核基本發(fā)病信息結(jié)合, 有利于了解結(jié)核病感染和控制全貌；2005年3月20日啟動艾滋病專病報告系統(tǒng), 使HIV追蹤、治療信息和全國HIV感染的基本發(fā)病信息結(jié)合, 有利于了解HIV感染和控制全貌。